1981年，人類免疫缺陷病毒在美國被首次發現。作為一種逆轉錄病毒，人類免疫缺陷系統會導致免疫系統缺陷。HIV存在多種類型，這些類型的具體病因也不盡相同。

　　人類免疫缺陷病毒的英文全稱是Human Immunodeficiency Virus，簡稱HIV病毒。HIV基因全長約9.8kb，含有gag、pol、env3個結構基因、2個調節基因(tat反式激活因子、rev毒粒蛋白表達調節子)和4個輔助基因(nef負調控因子、vpr病毒r蛋白、vpu病毒u蛋白和vif毒粒感染性因子)。

　　HIV是一種變異性很強的病毒，各基因的變異程度不同，env基因變異率最高。HIV發生變異的主要原因包括逆轉錄酶無校正功能導致的隨機變異;宿主的免疫選擇壓力;不同病毒DNA之ARV、病毒DNA與宿主DNA之間的基因重組;以及藥物選擇壓力，其中不規范的抗病毒治療是導致耐藥性的重要原因。

　　對于患HIV的患者，如果通過及時的治療控制病情，在患病之后，會因為免疫系統的破壞失去自身的免疫能力，最終因為在患其他病癥時候無法產生抗體很容易致命。所以HIV的名稱叫做獲得性免疫缺乏綜合癥。

　　當前治療HIV病毒感染存在的問題是HIV病毒的高遺傳變異性。

　　HIV包括HIV-1型和HIV-2型，HIV-1型和HIV-2型又包括多種亞型，這兩種HIV病毒的氨基酸序列包含40%～60%的同源性，但是HIV-1的傳染能力更強。

　　HIV-1 的來源是中非，后來開始擴展到了海外乃至全世界，HIV-1能夠侵犯人體的CD4 T淋巴細胞，單核巨噬細胞亞群，對B細胞、小神經膠質細胞及骨髓干細胞也能實現破壞，是引發獲得性免疫缺陷綜合征的病毒源頭。

　　而HIV-2則是在西非分離出的一種逆轉錄病毒，它的主要存在地區是西非，當然在美國和歐洲，南非，美國和我國國內也都出現了少數的案例。

　　HIV-1分為3個亞型組13個亞型：

　　M亞型組包括A、 B、C、D、E、F、G、H、I、J和K共11個亞型。

　　N亞型組只有N亞型，N組是前些年才從兩名喀麥隆病人分離到的，在系統樹上，既不屬于M組，也不屬于O組的一組新病毒，故稱N組。

　　O亞型組只有O亞型，O亞型組是1990年從喀麥隆和加蓬分離到的，與M組其它亞型的氨基酸序列只有50%的同源性。各亞型env基因核酸序列差異性平均為30%。

　　HIV-2至少有A、B、C、D、E、F、G7個亞型，我國以HIV-1為主要流行株。已發現的有A、B(歐美B)、B′(泰國B)、C、D、E、F和G8個亞型，還有不同的流行重組型。1999年起在部分地區發現并證實我國有少數HIV-2型感染者。

　　綜上，與M亞型相比，O亞型的艾滋病病毒比較少見，不過這種O亞型的艾滋病病毒是隸屬于HIV-1的，用普通的艾滋病檢測方法都能夠檢測的到，不管是酶聯法還是艾滋病試紙都能夠檢測出所有的病毒亞型。

　　中國艾滋病病毒主要流行的是AE亞型，占比為46%，同時發現該毒株X4嗜性，該毒株毒株成了中國流行毒株。

　　這個毒株成了中國流行株的始祖病毒(founder virus)，這個病毒是R4嗜酸性，如果要編輯基因應該編輯CXCR4.但敲除CXCR4會影響胚胎發育，所以不能敲除CXCR4。所以敲除CCR5不能預防艾滋病，除了基因編輯本身的風險，還可能影響免疫發育，目前其風險不得而知。

　　對于通過控制CCR5基因控制的CCR5表達，不能完成對艾滋病的全部類型的免疫，從這個方面來看，對嬰兒的CCR5基因的操作并不能完全保證孩子獲得了艾滋病免疫的能力。