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摘要:基因測(cè)序是一種新型的基因檢測(cè)技術(shù),通過分析測(cè)定基因全序列可以有效預(yù)防疾病。近幾年,基因測(cè)序技術(shù)在臨床醫(yī)學(xué)中應(yīng)用較廣。本文結(jié)合基因測(cè)序技術(shù)的發(fā)展歷程,重點(diǎn)分析了其技術(shù)原理特點(diǎn)及市場(chǎng)份額。
基因是DNA分子上的一個(gè)功能片段,可決定生物物種的生老病死,是生命的調(diào)控者?;驕y(cè)序技術(shù)可為生命科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)臨床診療等提供指導(dǎo)性的建議,即通過測(cè)序設(shè)備對(duì)DNA的堿基排列順序進(jìn)行測(cè)定,解讀DNA的遺傳密碼。
技術(shù)發(fā)展飛快,基因測(cè)序技術(shù)發(fā)展歷經(jīng)四個(gè)發(fā)展階段
基因測(cè)序技術(shù),又稱DNA測(cè)序技術(shù),是進(jìn)一步研究和改造目的基因的基礎(chǔ)。技術(shù)發(fā)展較快,臨床應(yīng)用逐漸增多,經(jīng)過幾十年的發(fā)展,該技術(shù)前后經(jīng)歷了四代技術(shù)變革。該項(xiàng)技術(shù)的研究起源于20世紀(jì)70年代中期,起初采用化學(xué)降解法及雙脫氧鏈終止法,隨著科技的不斷進(jìn)步,20世紀(jì)90年代,隨著熒光自動(dòng)測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn),基因測(cè)序技術(shù)開啟了自動(dòng)化測(cè)序時(shí)代,這些均稱為第一代基因測(cè)序技術(shù)。隨著一次可以針對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn),基因測(cè)序技術(shù)迎來了第二代測(cè)序技術(shù),又稱高通量測(cè)序技術(shù),可謂是傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)的一次革命。隨后出現(xiàn)的第三代測(cè)序技術(shù)是第二代測(cè)序技術(shù)的升級(jí),是高通量、單分子測(cè)序,增加了讀長(zhǎng),降低了成本,有效提高了測(cè)序效率。第四代測(cè)序技術(shù)為納米孔測(cè)序技術(shù),該方法不需要對(duì)DNA進(jìn)行化學(xué)或生物處理,采用物理方法直接讀取DNA序列,即通道的電學(xué)性質(zhì)會(huì)隨單個(gè)堿基通過納米尺度通道的變化而變化。
技術(shù)不斷革新,新一代基因測(cè)序儀速度快、成本低且高通量
第一代測(cè)序技術(shù)包括化學(xué)降解法、雙脫氧鏈終止法、毛細(xì)管電泳和熒光測(cè)序、雜交測(cè)序技術(shù)。其中,化學(xué)降解法中, 通過標(biāo)記DNA片段—獨(dú)立化學(xué)反應(yīng)降解—特異性分子標(biāo)記—凝膠電泳—放射自顯影檢測(cè)的方法,對(duì)DNA分子進(jìn)行測(cè)序,排除通過酶促合成產(chǎn)生的拷貝時(shí)造成的錯(cuò)誤,提高了方法準(zhǔn)確性、易掌握性,使用較為廣泛。但是,該方法操作較為復(fù)雜,逐漸被雙脫氧鏈終止法替代。雙脫氧鏈終止法,操作較為簡(jiǎn)便,而后在此基礎(chǔ)上發(fā)展出包括英國自動(dòng)測(cè)序技術(shù)在內(nèi)的多種DNA測(cè)序技術(shù)。熒光自動(dòng)測(cè)序技術(shù),用熒光替代同位素標(biāo)記,并用成像系統(tǒng)自動(dòng)檢測(cè),可以有效提高測(cè)序準(zhǔn)確性及速度。另外,雜交測(cè)序技術(shù),利用DNA雜交原理,檢測(cè)速度快、可大幅降低檢測(cè)成本,但此方法誤差較大。
第二代測(cè)序技術(shù)明顯的特征是高通量,并且大大降低了測(cè)序成本,邊合成邊測(cè)序的方式,促使測(cè)序速度大幅度提高,方便對(duì)一個(gè)物種進(jìn)行基因組深度測(cè)序,推動(dòng)了基因測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,加速了測(cè)序的規(guī)?;M(jìn)程。第三代測(cè)序技術(shù)在第二代高通量的基礎(chǔ)上,增添了單分子測(cè)序元素,不再依賴DNA模板與固體表面相結(jié)合的方式,無需進(jìn)行PCR擴(kuò)增。第四代基因測(cè)序技術(shù),目前處于發(fā)展階段,與前幾代技術(shù)相比,在成本及速度上有很大優(yōu)勢(shì)。
HiSeq系列測(cè)序儀不斷升級(jí),基因測(cè)序儀器行業(yè)呈現(xiàn)寡頭壟斷格局
經(jīng)過多年發(fā)展,基因測(cè)序儀的核心技術(shù)不斷完善,企業(yè)在生產(chǎn)開發(fā)中通常會(huì)設(shè)計(jì)與之匹配的測(cè)序試劑以及耗材,但是,市場(chǎng)主要還是測(cè)序儀的競(jìng)爭(zhēng)。數(shù)據(jù)顯示,全球測(cè)序儀器市場(chǎng)的主要份額主要由Illumina及賽默飛世爾占據(jù),市場(chǎng)份額高達(dá)九成,行業(yè)形成寡頭壟斷的格局。此前,Illumina占據(jù)了全球測(cè)序儀器市場(chǎng)71%的份額,賽默飛世爾市場(chǎng)占有率為16%,羅氏市場(chǎng)占有率為10%。近幾年,借助于HiSeq系列測(cè)序儀的不斷升級(jí)和推廣,Illumina 繼續(xù)擴(kuò)大市場(chǎng)份額,逐漸增至84%。
圖1 全球新一代測(cè)序儀市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)格局
(數(shù)據(jù)來源:中國產(chǎn)業(yè)信息網(wǎng))
結(jié)語
近年來,基因測(cè)序技術(shù)發(fā)展迅速,前后歷經(jīng)了四個(gè)發(fā)展階段,新一代的基因測(cè)序技術(shù)具有高通量、成本低、速度快等優(yōu)勢(shì),在醫(yī)學(xué)臨床應(yīng)用較廣。隨著應(yīng)用的不斷增多,基因測(cè)序儀器的生產(chǎn)企業(yè)市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)不斷增大,隨著HiSeq系列測(cè)序儀的不斷升級(jí)和推廣,Illumina市場(chǎng)份額逐漸擴(kuò)大,行業(yè)逐漸呈現(xiàn)寡頭壟斷的格局。
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