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全面提升數(shù)據(jù)價值
賦能業(yè)務(wù)提質(zhì)增效
摘要:基因測序是一種新型的基因檢測技術(shù),通過分析測定基因全序列可以有效預(yù)防疾病。近幾年,基因測序技術(shù)在臨床醫(yī)學(xué)中應(yīng)用較廣。本文結(jié)合基因測序技術(shù)的發(fā)展歷程,重點分析了其技術(shù)原理特點及市場份額。
基因是DNA分子上的一個功能片段,可決定生物物種的生老病死,是生命的調(diào)控者。基因測序技術(shù)可為生命科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)臨床診療等提供指導(dǎo)性的建議,即通過測序設(shè)備對DNA的堿基排列順序進行測定,解讀DNA的遺傳密碼。
技術(shù)發(fā)展飛快,基因測序技術(shù)發(fā)展歷經(jīng)四個發(fā)展階段
基因測序技術(shù),又稱DNA測序技術(shù),是進一步研究和改造目的基因的基礎(chǔ)。技術(shù)發(fā)展較快,臨床應(yīng)用逐漸增多,經(jīng)過幾十年的發(fā)展,該技術(shù)前后經(jīng)歷了四代技術(shù)變革。該項技術(shù)的研究起源于20世紀(jì)70年代中期,起初采用化學(xué)降解法及雙脫氧鏈終止法,隨著科技的不斷進步,20世紀(jì)90年代,隨著熒光自動測序技術(shù)的出現(xiàn),基因測序技術(shù)開啟了自動化測序時代,這些均稱為第一代基因測序技術(shù)。隨著一次可以針對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測序技術(shù)的出現(xiàn),基因測序技術(shù)迎來了第二代測序技術(shù),又稱高通量測序技術(shù),可謂是傳統(tǒng)測序技術(shù)的一次革命。隨后出現(xiàn)的第三代測序技術(shù)是第二代測序技術(shù)的升級,是高通量、單分子測序,增加了讀長,降低了成本,有效提高了測序效率。第四代測序技術(shù)為納米孔測序技術(shù),該方法不需要對DNA進行化學(xué)或生物處理,采用物理方法直接讀取DNA序列,即通道的電學(xué)性質(zhì)會隨單個堿基通過納米尺度通道的變化而變化。
技術(shù)不斷革新,新一代基因測序儀速度快、成本低且高通量
第一代測序技術(shù)包括化學(xué)降解法、雙脫氧鏈終止法、毛細管電泳和熒光測序、雜交測序技術(shù)。其中,化學(xué)降解法中, 通過標(biāo)記DNA片段—獨立化學(xué)反應(yīng)降解—特異性分子標(biāo)記—凝膠電泳—放射自顯影檢測的方法,對DNA分子進行測序,排除通過酶促合成產(chǎn)生的拷貝時造成的錯誤,提高了方法準(zhǔn)確性、易掌握性,使用較為廣泛。但是,該方法操作較為復(fù)雜,逐漸被雙脫氧鏈終止法替代。雙脫氧鏈終止法,操作較為簡便,而后在此基礎(chǔ)上發(fā)展出包括英國自動測序技術(shù)在內(nèi)的多種DNA測序技術(shù)。熒光自動測序技術(shù),用熒光替代同位素標(biāo)記,并用成像系統(tǒng)自動檢測,可以有效提高測序準(zhǔn)確性及速度。另外,雜交測序技術(shù),利用DNA雜交原理,檢測速度快、可大幅降低檢測成本,但此方法誤差較大。
第二代測序技術(shù)明顯的特征是高通量,并且大大降低了測序成本,邊合成邊測序的方式,促使測序速度大幅度提高,方便對一個物種進行基因組深度測序,推動了基因測序技術(shù)的發(fā)展,加速了測序的規(guī)模化進程。第三代測序技術(shù)在第二代高通量的基礎(chǔ)上,增添了單分子測序元素,不再依賴DNA模板與固體表面相結(jié)合的方式,無需進行PCR擴增。第四代基因測序技術(shù),目前處于發(fā)展階段,與前幾代技術(shù)相比,在成本及速度上有很大優(yōu)勢。
HiSeq系列測序儀不斷升級,基因測序儀器行業(yè)呈現(xiàn)寡頭壟斷格局
經(jīng)過多年發(fā)展,基因測序儀的核心技術(shù)不斷完善,企業(yè)在生產(chǎn)開發(fā)中通常會設(shè)計與之匹配的測序試劑以及耗材,但是,市場主要還是測序儀的競爭。數(shù)據(jù)顯示,全球測序儀器市場的主要份額主要由Illumina及賽默飛世爾占據(jù),市場份額高達九成,行業(yè)形成寡頭壟斷的格局。此前,Illumina占據(jù)了全球測序儀器市場71%的份額,賽默飛世爾市場占有率為16%,羅氏市場占有率為10%。近幾年,借助于HiSeq系列測序儀的不斷升級和推廣,Illumina 繼續(xù)擴大市場份額,逐漸增至84%。
圖1 全球新一代測序儀市場競爭格局
(數(shù)據(jù)來源:中國產(chǎn)業(yè)信息網(wǎng))
結(jié)語
近年來,基因測序技術(shù)發(fā)展迅速,前后歷經(jīng)了四個發(fā)展階段,新一代的基因測序技術(shù)具有高通量、成本低、速度快等優(yōu)勢,在醫(yī)學(xué)臨床應(yīng)用較廣。隨著應(yīng)用的不斷增多,基因測序儀器的生產(chǎn)企業(yè)市場競爭不斷增大,隨著HiSeq系列測序儀的不斷升級和推廣,Illumina市場份額逐漸擴大,行業(yè)逐漸呈現(xiàn)寡頭壟斷的格局。
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